理論海洋化學課程的核心基本內涵是講解與應用物理化學、海洋化學、介面科學的理論和方法，研究討論海洋中的化學問題和地球化學過程，海水中各種形態化學元素在各種海洋介面上遷移、轉化過程機理，包括水、海水、懸浮顆粒、沉積物和沉積物間隙水等的組成、物理化學性質和結構、海洋及其它聯結環境(大氣、海床、河口等)所組成的水循序統體係中發生的一切物理化學過程。